MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio fischeri MJ11 chromosome II

Total Repeats: 26595

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011186	AAAGA	2	10	1097	1106	80 %	0 %	20 %	0 %	197337153
2	NC_011186	CAA	2	6	1158	1163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197337153
3	NC_011186	AAT	2	6	1288	1293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197337153
4	NC_011186	AAC	2	6	1297	1302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197337153
5	NC_011186	GCA	2	6	1322	1327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197337153
6	NC_011186	CTG	2	6	1347	1352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197337153
7	NC_011186	ATT	2	6	1363	1368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197337153
8	NC_011186	CAA	2	6	1370	1375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197337153
9	NC_011186	TTA	2	6	1428	1433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197337153
10	NC_011186	CCT	2	6	1577	1582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197337153
11	NC_011186	TGA	2	6	1591	1596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197337153
12	NC_011186	GTA	2	6	1610	1615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197337153
13	NC_011186	AACT	2	8	1621	1628	50 %	25 %	0 %	25 %	197337153
14	NC_011186	CCA	2	6	1658	1663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197337153
15	NC_011186	A	6	6	1672	1677	100 %	0 %	0 %	0 %	197337153
16	NC_011186	ATT	2	6	1718	1723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197337153
17	NC_011186	TCT	2	6	1733	1738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197337153
18	NC_011186	CAT	2	6	1744	1749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197337153
19	NC_011186	TGA	2	6	1756	1761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197337153
20	NC_011186	TTTA	2	8	1780	1787	25 %	75 %	0 %	0 %	197337153
21	NC_011186	ATC	3	9	1809	1817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197337153
22	NC_011186	CAAA	2	8	1835	1842	75 %	0 %	0 %	25 %	197337153
23	NC_011186	A	6	6	1898	1903	100 %	0 %	0 %	0 %	197337153
24	NC_011186	T	6	6	2038	2043	0 %	100 %	0 %	0 %	197337153
25	NC_011186	TGA	2	6	2065	2070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197337153
26	NC_011186	AAG	2	6	2079	2084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197337153
27	NC_011186	GATCAA	2	12	2098	2109	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	197337153
28	NC_011186	CAT	2	6	2139	2144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197337153
29	NC_011186	ATG	2	6	2148	2153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197337153
30	NC_011186	ATT	2	6	2155	2160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197337153
31	NC_011186	CTT	2	6	2173	2178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197337153
32	NC_011186	CTT	2	6	2233	2238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197337153
33	NC_011186	CTCG	2	8	2300	2307	0 %	25 %	25 %	50 %	197337153
34	NC_011186	AAC	2	6	2515	2520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197337153
35	NC_011186	CAA	2	6	2547	2552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197337153
36	NC_011186	TGA	2	6	2716	2721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197337153
37	NC_011186	TGA	2	6	2821	2826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197337153
38	NC_011186	ATT	2	6	2853	2858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197337153
39	NC_011186	TAAG	2	8	2895	2902	50 %	25 %	25 %	0 %	197337153
40	NC_011186	TTC	2	6	3027	3032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197337153
41	NC_011186	AAACA	2	10	3424	3433	80 %	0 %	0 %	20 %	197337738
42	NC_011186	ATTT	2	8	3468	3475	25 %	75 %	0 %	0 %	197337738
43	NC_011186	CAA	2	6	3499	3504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197337738
44	NC_011186	TCT	2	6	3548	3553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197337738
45	NC_011186	AGCA	2	8	3559	3566	50 %	0 %	25 %	25 %	197337738
46	NC_011186	AATG	2	8	3632	3639	50 %	25 %	25 %	0 %	197337738
47	NC_011186	GAAA	2	8	4558	4565	75 %	0 %	25 %	0 %	197337026
48	NC_011186	AG	3	6	4567	4572	50 %	0 %	50 %	0 %	197337026
49	NC_011186	T	8	8	4640	4647	0 %	100 %	0 %	0 %	197337026
50	NC_011186	TTGA	2	8	4649	4656	25 %	50 %	25 %	0 %	197337026
51	NC_011186	T	7	7	4707	4713	0 %	100 %	0 %	0 %	197337026
52	NC_011186	AGA	2	6	4735	4740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197337026
53	NC_011186	TAA	2	6	4747	4752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197337026
54	NC_011186	T	7	7	4818	4824	0 %	100 %	0 %	0 %	197337026
55	NC_011186	TAG	2	6	4843	4848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197337026
56	NC_011186	AG	3	6	4847	4852	50 %	0 %	50 %	0 %	197337026
57	NC_011186	TAA	2	6	4855	4860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197337026
58	NC_011186	A	7	7	4862	4868	100 %	0 %	0 %	0 %	197337026
59	NC_011186	AGA	2	6	4918	4923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197337026
60	NC_011186	ATT	2	6	4955	4960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197337026
61	NC_011186	AGAA	2	8	4996	5003	75 %	0 %	25 %	0 %	197337026
62	NC_011186	TTA	2	6	5025	5030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197337026
63	NC_011186	TA	3	6	5082	5087	50 %	50 %	0 %	0 %	197337026
64	NC_011186	AAAG	2	8	5094	5101	75 %	0 %	25 %	0 %	197337026
65	NC_011186	AT	4	8	5107	5114	50 %	50 %	0 %	0 %	197337026
66	NC_011186	AACAA	2	10	5123	5132	80 %	0 %	0 %	20 %	197337026
67	NC_011186	AAG	2	6	5138	5143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197337026
68	NC_011186	TTA	2	6	5168	5173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197337026
69	NC_011186	CTA	2	6	5176	5181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197337026
70	NC_011186	TA	3	6	5180	5185	50 %	50 %	0 %	0 %	197337026
71	NC_011186	TCA	2	6	5246	5251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197337026
72	NC_011186	A	6	6	5303	5308	100 %	0 %	0 %	0 %	197337026
73	NC_011186	ATAA	2	8	5320	5327	75 %	25 %	0 %	0 %	197337026
74	NC_011186	TTC	2	6	5411	5416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197337332
75	NC_011186	GCT	2	6	5451	5456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197337332
76	NC_011186	CAA	2	6	5461	5466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197337332
77	NC_011186	TTA	2	6	5487	5492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197337332
78	NC_011186	TCT	2	6	5634	5639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197337332
79	NC_011186	ACG	2	6	5646	5651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197337332
80	NC_011186	T	6	6	5758	5763	0 %	100 %	0 %	0 %	197337332
81	NC_011186	CTT	2	6	5772	5777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197337332
82	NC_011186	CAA	2	6	5788	5793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197337332
83	NC_011186	TGC	2	6	5837	5842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197337332
84	NC_011186	TAA	2	6	5852	5857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197337332
85	NC_011186	TTTG	2	8	5859	5866	0 %	75 %	25 %	0 %	197337332
86	NC_011186	CAG	2	6	5941	5946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197337332
87	NC_011186	ATT	2	6	6020	6025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197337332
88	NC_011186	CTT	2	6	6073	6078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197337332
89	NC_011186	TTC	2	6	6134	6139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197337332
90	NC_011186	TGT	2	6	6152	6157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197337332
91	NC_011186	ATT	2	6	6348	6353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197337332
92	NC_011186	TCC	2	6	6362	6367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197337332
93	NC_011186	TCA	2	6	6376	6381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197337332
94	NC_011186	ATT	2	6	6420	6425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197337332
95	NC_011186	GAG	2	6	6426	6431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197337332
96	NC_011186	TAA	2	6	6440	6445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197337332
97	NC_011186	CTT	2	6	6538	6543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197337332
98	NC_011186	T	8	8	6560	6567	0 %	100 %	0 %	0 %	197337332
99	NC_011186	ATC	2	6	6659	6664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197337332
100	NC_011186	TATTTT	2	12	6697	6708	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	197337332
101	NC_011186	ATTTT	2	10	6730	6739	20 %	80 %	0 %	0 %	197337332
102	NC_011186	ATT	2	6	6740	6745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197337332
103	NC_011186	AAT	2	6	6776	6781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197337332
104	NC_011186	T	6	6	6837	6842	0 %	100 %	0 %	0 %	197337332
105	NC_011186	A	6	6	6866	6871	100 %	0 %	0 %	0 %	197337332
106	NC_011186	T	7	7	6923	6929	0 %	100 %	0 %	0 %	197337332
107	NC_011186	TGAT	2	8	7083	7090	25 %	50 %	25 %	0 %	197336944
108	NC_011186	ATT	2	6	7092	7097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197336944
109	NC_011186	CGA	2	6	7129	7134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197336944
110	NC_011186	AAT	2	6	7182	7187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336944
111	NC_011186	AAAG	2	8	7195	7202	75 %	0 %	25 %	0 %	197336944
112	NC_011186	GTA	2	6	7225	7230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197336944
113	NC_011186	T	8	8	7264	7271	0 %	100 %	0 %	0 %	197336944
114	NC_011186	TA	3	6	7451	7456	50 %	50 %	0 %	0 %	197337210
115	NC_011186	CAAC	2	8	7498	7505	50 %	0 %	0 %	50 %	197337210
116	NC_011186	TTA	2	6	7507	7512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197337210
117	NC_011186	TAT	2	6	7527	7532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197337210
118	NC_011186	TTC	2	6	7545	7550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197337210
119	NC_011186	ATTT	2	8	7564	7571	25 %	75 %	0 %	0 %	197337210
120	NC_011186	ATA	2	6	7604	7609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197337210
121	NC_011186	TCT	2	6	7618	7623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197337210
122	NC_011186	A	7	7	7693	7699	100 %	0 %	0 %	0 %	197337210
123	NC_011186	A	7	7	7707	7713	100 %	0 %	0 %	0 %	197337210
124	NC_011186	ATT	2	6	7716	7721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197337210
125	NC_011186	TTA	2	6	7722	7727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197337210
126	NC_011186	TGA	2	6	7770	7775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197337210
127	NC_011186	ATA	2	6	7806	7811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197337210
128	NC_011186	AAT	2	6	7873	7878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336816
129	NC_011186	CAC	2	6	7902	7907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197336816
130	NC_011186	ACC	2	6	8116	8121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197336816
131	NC_011186	ATT	2	6	8156	8161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197336816
132	NC_011186	AGCT	2	8	8172	8179	25 %	25 %	25 %	25 %	197336816
133	NC_011186	CAT	2	6	8302	8307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197336816
134	NC_011186	TCG	2	6	8322	8327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197336816
135	NC_011186	TAAG	2	8	8365	8372	50 %	25 %	25 %	0 %	197336816
136	NC_011186	T	8	8	8377	8384	0 %	100 %	0 %	0 %	197336816
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